胃肠道间质瘤是相对恶性程度偏低的肿瘤，靶向药物治疗效果较好，胃肠道间质瘤转移以后，如果能得到有效治疗，存活时间相对较长，可存活3-5年甚至更长时间。一方面与转移数目、大小及分布在不同器官有关，一方面也与患者身体条件、个体差异有关，但可以肯定的是胃肠道间质瘤即便转移以后用药物治疗，效果也比较好。如果患者已经出现胃肠道间质瘤转移，局部转移可以通过手术方式来再次手术，进行切除，反复切除，如果出现全身转移，则可以通过靶向药物治疗来抑制控制肿瘤生长，尽可能延长患者生命。目前靶向药物治疗对胃肠道间质瘤非常有效，出现转移后如果能得到有效治疗，非常有希望生存3-5年甚至更长时间。