早上起来肾疼最有可能的是泌尿系结石的出现。泌尿系结石是临床上非常常见的一种泌尿系统疾病，如果出现症状，并不与相应的时间有关系。比如并不是早上就更容易发生，或者是这一天中的某一个时间段更容易发生。也就是如果泌尿系结石，石头在沿着正常的泌尿系统往下排的过程中，卡在了输尿管某处狭窄的位置，这时候都会引起非常典型的肾绞痛。同时这种疼痛会非常的剧烈，患者没有任何体体位，可以缓解。同时患者可能会伴有明显的恶心、呕吐，还会出现血尿情况。所以患者一旦出现这种情况，就需要到医院就诊，通过完善相应的辅助检查，包括B超、CT等明确诊断。如果诊断明确，就可以采取下一步的治疗方式。