包皮溃疡根据不同原因，使用的药物有所不同，具体如下：1、浅表性溃疡性包皮龟头炎：病人发生浅表性溃疡性包皮龟头炎时，可以用碘伏局部涂抹，还可以用百多邦局部涂抹。病人出现支原体、衣原体反复感染引起包皮溃疡、糜烂时，可以用红霉素软膏局部涂抹；2、梅毒感染：病人发生梅毒螺旋菌感染时，会引起包皮隆起性溃疡，边界清楚呈圆形，触摸时质地较硬，常不伴有疼痛或瘙痒症状。溃疡面有浆液性分泌物，做血清学检测时如梅毒螺旋体阳性，可以使用长效青霉素肌注治疗，通过足量疗程的青霉素治疗后，多数病人由梅毒引起的硬下疳症状会明显好转。软下疳常由短棒状杆菌感染引起，可以选用头孢哌酮加舒巴坦静脉输液治疗，局部使用碘伏消毒治疗。通过上述药物治疗后，由软下疳引起的包皮溃疡症状也会明显好转。