患者出现慢性感染性腹泻的常见病因如下：1、细菌感染：如志贺氏细菌感染会导致细菌性痢疾，以及沙门氏菌感染会导致伤寒等；2、病毒感染：如巨细胞病毒感染、EB病毒感染等；3、真菌感染：真菌感染是慢性腹泻的常见病因，尤其免疫力较低的患者，如患有艾滋病或糖尿病的患者；4、原虫感染：如阿米巴感染，可以导致患者出现慢性腹泻；5、寄生虫感染：包括肠道血吸虫病、鞭虫病；6、其他：包括经肠道结核感染，以及患者常使用抗生素的情况下可出现二重感染，进而引起腹泻。