发烧患者伴有腿酸疼的原因主要如下：1、体温调定点上调：主要由于致热原作用，导致体内前列腺素E的合成增加，因为前列腺素E属于一种致痛剂，一般可以引起疼痛，所以通常伴有腿痛、头痛以及全身关节、肌肉疼痛等症状；2、无氧糖酵解增加：主要由于发热情况下，由于肌肉、血管收缩导致缺氧所致，无氧糖酵解的主要产物为乳酸，易导致乳酸在肌肉内沉积，由于乳酸增加通常表现为体内酸性环境，所以易出现上述症状；3、病原微生物感染：如病毒、细菌、支原体、衣原体、立克次氏体等感染，均可引起发烧，同时还伴有全身感染中毒症状；4、其它病因：如结缔组织病、恶性肿瘤、体内大创伤、出血、血肿以及组织坏死，均可能引起发烧，从而引起肌肉、腿部酸痛。