早晨膝盖疼，主要原因包括以下几点：1、生理性因素：可能是前一天活动、运动得比较多，也可能是由于外出旅游时，走路比较多，导致晨起后膝盖会有轻度疼痛，通常在活动之后会缓解；2、病理性因素：如类风湿性关节炎，患者通常会出现晨僵，不仅出现膝盖的疼痛，还会伴有双手多关节的僵硬和疼痛。综上所述，如果患者在早晨出现膝盖疼痛，常见于生理性的活动度过大、过多，膝盖使用得过于剧烈，和病理性的类风湿性关节炎。同时，还有其他较少见的原因，也可能导致患者出现早晨膝盖疼的症状。