脸上长小疙瘩的主要原因，如下所示：1、痤疮：又称青春痘，分类较多，包括以红色毛囊炎为主要表现的青春痘，应以抗炎治疗为主。以白头、黑头，以及以多个结节、囊肿、瘢痕为主要表现的青春痘，可口服维甲酸类药物治疗；2、扁平疣：即出现在脸上的单个小疙瘩，属于病毒感染性皮肤疾病，与人乳头瘤病毒感染密切相关，需进行抗病毒治疗；3、色素痣：即出现在脸上的单个小疙瘩，表现为褐色、淡褐色或深褐色，可通过手术切除或进行冷冻治疗。因此，脸上长的小疙瘩类型很多，需要注意细心区分，根据不同情况采用不同方法处理。