小脑萎缩可以见于某些神经系统变性疾病，比如多系统萎缩，可能表现为小脑萎缩，可以发现小脑的沟回加深。还有后颅窝小脑扁桃体容积变小，通常由于神经系统变性疾病引起小脑萎缩，目前没有比较好的治疗办法来治愈疾病。有些患者可以服用辅酶Q10来治疗此疾病，但目前也可能仅为辅助治疗，比较难以延缓疾病的进展。像多系统萎缩这样的疾病，最终平均的病程可能为5-6年，病人就会整体退化得比较严重。