男人的下面长水疱，最常见的原因是生殖器疱疹，这是一种与性传播相关的疾病，致病的病原体是疱疹病毒。所以对于此类情况，首先需要询问男人有无不洁的性接触，或者是一些沾染了病毒的内衣裤。在治疗上可以口服抗病毒的药物，或者联合使用一些阿昔洛韦软膏，这是一种抗病毒的外用药，一般连续使用2-3周，症状都会有很好的改善。​生殖器疱疹在临床上另外特别显著的表现是痒，在治疗此疾病时，还要注意保持生殖器的卫生，可以用1:3000的高锰酸钾溶液泡洗。但是切记浓度不要配比过高，水有淡淡的红色就可以。另外，对于存在包皮过长或包皮炎的男人，反复发作或者包茎，要尽早做包皮环切手术，否则此种疱疹还容易再次复发。对于男人下面长水疱还有一种可能，是慢性尿道炎，长期炎症在尿道外口和周边，会形成一些慢性炎症的囊肿。对于这种情况，一般建议做小的手术切除就好了。