打完流脑疫苗后发烧，通常属于接种疫苗的一种常见反应，如果出现上述的情况，一般无需过度紧张，可以按照以下的方法进行处理：1、物理降温：如果体温<38.5℃，可以通过多喝水，采取物理降温的方法来退烧。还可以使用冰袋敷额部、颈部、肘窝、腘窝等有大动脉经过的地方，也可以用75%的酒精稀释以后进行擦拭，擦拭的部位与放冰袋的部位相同，主要在有大动脉通过的地方，通过酒精的挥发将体内的热量带走，起到退烧的作用；2、药物降温：如果体温>38.5℃，可以用退烧药如对乙酰氨基酚、布洛芬来进行退烧；3、及时送医：如果体温迟迟不退，或者持续上升，且患者出现神志不好，或者出现意识不清、昏迷、呼吸困难等严重的反应，则需要及时到医院进行进一步的治疗。