胃肠道间质瘤如果伴发了肝转移，其治疗方法主要取决于患者的具体情况，常用的治疗方法有手术切除、血管介入治疗、射频消融等，常见分析如下：1、手术切除：切除手术主要针对于原发灶可以切除，病灶转移比较局限的患者，通常可选择切除原发灶和转移灶。如果肝转移比较广泛，甚至与其他部位的转移合并，此时通常需要进行活检，在明确诊断后使用伊马替尼等靶向药物进行治疗，并定期进行影像评估，评估的时间是每3个月一次；2、血管介入治疗：主要针对于胃肠道间质瘤伴肝转移时，转移瘤局部血管丰富的情况，此时可考虑血管介入栓塞，通过血管介入，碘油阻断肿瘤周围的血管，使肿瘤细胞缺乏血液营养供应，造成缺血性坏死，从而达到控制肿瘤的目的；3、射频消融手术：主要针对于恶性胃肠道间质瘤伴肝转移的情况，当转移瘤相对局限，并且患者无法手术，或患者不愿意接受手术切除时，可在CT、彩色多普勒超声引导下进行射频消融，通过电击加热肿瘤细胞达到变性坏死，控制肿瘤，也可局部注射无水酒精，使肿瘤细胞变性坏死，达到控制肿瘤的目的。