直肠检查主要有以下方式：1、肛门指诊：是最基本的检查，即用手指触摸肛门，但可以摸到的部位有限；2、结肠镜：通过结肠镜可以看到整个大肠，做结肠镜检查前，需要喝泻药将肠道清干净，以使结肠镜看得更清楚；3、影像学检查：如CT、磁共振等，针对直肠的检查最常用的是磁共振，因为直肠位于盆腔，而磁共振对于盆腔检查的分辨率、清晰程度以及重要信息等会更完善；4、其他方式：肛门镜。