女性排尿时小肚子疼是典型的膀胱炎的临床表现，由于尿道外口毗邻阴道和肛门，周围常见的致病菌比如大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、变形杆菌容易在泌尿黏膜上皮增殖，造成逆行感染，在排尿时膀胱会剧烈收缩，本身黏膜有细菌导致的炎症，因此会诱发小肚子疼，由于是细菌感染所致的疾病，因此首选抗生素，常见的抗生素如下：1、喹诺酮类抗生素：通常最先推荐，比如左氧氟沙星，这一类药物在尿液中有效的杀菌浓度较高，且本身高效、低毒，因此是治疗的首选，一般治疗一周症状就会消失，需要再次复查尿常规，直至尿常规中白细胞转阴才算治疗终止；2、头孢类抗生素：如果女性＜18岁，或者在妊娠哺乳阶段，可以选择头孢类抗生素，比如头孢克洛，临床上也非常常见且价格低廉，而且头孢抗生素只有一个禁忌证，就是没有头孢类过敏史或青霉素过敏史；3、中药：还有一大类是在祖国医学中关于治疗淋证的药物，比如癃清片、三金片、金钱草，在临床上也有很好的治疗效果。