大脑半球手术可能导致中枢的功能损害，出现相应的后遗症，比如偏瘫、失语、癫痫，或者视野缺损；如果丘脑或者下丘脑损伤，也可能导致病人昏迷。人体具有两侧大脑半球，对于右利手的人群来说，左侧是优势半球，优势半球具有语言、书写中枢。另外，双侧的大脑半球都具有运动、感觉、视力中枢，大脑半球深部的丘脑、下丘脑也是基本的生命中枢。随着近年来我国神经外科的水平不断提高，大脑半球的手术并发症越来越低，大部分病人的神经功能都能得到良好的保护。