多数患者使用西地碘含片治疗口腔溃疡效果较好。由于西地碘含碘成分，而在临床中治疗口腔溃疡常用药为碘甘油，当中也含有碘，涂抹在口腔溃疡面可起到消炎、镇痛及愈合口腔黏膜作用，因此对于治疗口腔溃疡效果较好。西地碘成分与碘甘油有相似之处，因此治疗口腔溃疡效果亦较好。部分患者可能涂抹西地碘后效果不理想，可试用西地碘含片含服，但需注意尽量让含片成分与口腔溃疡疼痛部位接触较广面积且较长时间。若效果仍不理想，则可选用其他药物，如口腔溃疡散、贝复新凝胶及给予辅助性的治疗口腔溃疡及感染的药物进行口服或漱口，以消除口腔感染与溃疡，可尽快痊愈。