正常情况下做肠镜检查不会感染疾病。肠镜检查目的是检查肠道疾病，比如炎症、息肉、溃疡性结肠炎、结肠癌等，在正规医院肠镜使用结束后需进行严格清洗、消毒，对患有乙肝、丙肝、梅毒或者艾滋等感染性疾病的患者会使用专用肠镜进行操作，且在操作结束之后会进行严格消毒。 因此，在正规医院做肠镜检查不会感染疾病。建议患者不要因害怕、担心传染上疾病而耽误肠镜检查，以及疾病的治疗。