孕妇扁桃体炎是否能自愈要看病程时间，若咽痛及发烧于3天内缓解，则问题较小，可于1周左右逐渐缓解和自愈。还要看扁桃体发炎是细菌感染导致的急性化脓性扁桃体炎，还是病毒感染导致的非化脓性扁桃体炎。具体如下：1、细菌感染导致的急性化脓性扁桃体炎：咽痛较剧烈并持续时间较长，扁桃体检查可发现明显红肿，表面出现脓栓且伴有发烧，持续3天不退，则需使用抗生素治疗，孕期注意使用对妊娠期安全的抗生素，如阿莫西林口服；2、病毒感染导致的非化脓性扁桃体炎：无需药物治疗，可进行观察，发烧会于3-5天内自行消退。对于非化脓性扁桃体炎以及咽炎通常会在1周左右逐渐缓解、自愈，无需药物治疗。