患者手指关节有坑，也就是手指关节凹陷，常见的原因有以下几种：1、外伤因素：手指关节容易受到外伤，如果由于外伤、活动劳累或是外界环境影响，出现局部水肿，水肿在关节部位也会出现凹凸不平的情况；2、占位性病变：部分囊肿或腱鞘肿瘤，如腱鞘巨细胞瘤或软组织肿瘤，都可以导致局部凸起，同时牵拉出现关节局部凹陷，而表现为关节凹凸不平的现象；3、特异性关节疾病：如患者有类风湿性滑膜炎或痛风性滑膜炎，患者都会出现关节凹凸不平，局部有硬结的情况；4、其它因素：如果患者出现滑膜水肿或滑膜炎，会导致患者手指关节局部凹凸不平。另外常见的退行性滑膜炎，例如随着患者年龄增大出现滑膜增生或者骨质疏松的患者，由于骨质疏松代偿出现骨刺增生，即局部有异常的骨凸起，表现为凹凸不平的情况。