头顶有块骨头凹陷的常见原因如下：1、婴幼儿时期：可能是因为囟门没有闭合所致。一般婴幼儿存在前囟门和后囟门，一定的年龄段会发生闭合，较小的时候属于正常的生理结构，无需担心；2、成年人：由于外伤导致局部骨头凹陷，可能存在局部骨折。如果凹陷的程度不大，在1cm以内，也不必特殊处理，一般能够自愈。经过2-3个月的调养，不会引发比较严重的情况。如果不是因为外伤导致，需观察是否存在代谢性因素或缺乏某种物质，比如缺乏维生素D，可导致钙质无法正常沉积。骨瘤导致骨破坏也可引起局部凹陷。因此，此类患者要到医院进行就诊，鉴别是由于何种原因导致，从而进行相应的处理。