经常头疼但医院查不出问题的原因可能是原发性头痛、紧张性头痛，也可能是生活习惯不良引起的。
原发性头痛，如偏头痛，通常与遗传因素有关，常在环境、心理等刺激下发作。紧张性头痛可能是长时间压力过大、过度紧张等因素引起的，通常不会出现器质性的病变。生活习惯不良，如长时间熬夜、饮食不规律、不注意保暖、缺乏锻炼等，都可能导致体质下降，从而容易出现头痛、头晕、乏力、精神萎靡等症状。
此外，也可能是脑血管疾病。比如当患者患有白质疾病或腔隙性脑梗死时，在疾病进展过程中会出现头痛和头晕。对于高血压、糖尿病和动脉硬化患者，头痛经常发生，需要注意脑血管疾病。此时，建议进行脑部MRI检查。对于基础疾病患者，有必要结合头颅血管的相关检查，确定头部本身是否存在器质性病变，如白质变性、脑梗死、脑出血等占位性病变。
以上信息仅供参考，经常头疼还是建议及时就医，以医生的判断和建议为准。
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