怀孕后卵巢囊肿是否会自己消失，主要取决于卵巢囊肿的类型和具体状况。
生理性卵巢囊肿，又称为黄体素化囊肿，是由女性体内激素水平变化导致的卵巢内形成囊状结构，一般不会损害女性的健康，且大多数没有临床症状，不会引起疼痛。这类囊肿在怀孕后可能会逐渐自行变小直至消失，一般情况下无需治疗。
病理性卵巢囊肿则可能不会因怀孕而消失，反而可能会随着胎儿的增大而增长，导致患者出现腹胀腹痛等症状。如果病理性囊肿直径小于4CM，且患者没有任何不适症状，可先不做治疗，定期进行复查。若患者出现腹胀腹痛等症状，则可能是因为囊肿逐渐增大或卵巢囊肿蒂扭转的所造成的，需及时到医院进行检查，听取医生建议，必要时可在怀孕中期进行腹腔镜下的卵巢囊肿清除手术，并在术后积极采取保胎治疗。
以上信息仅供参考，具体情况可能因个体差异和囊肿性质不同而有所区别。在怀孕期间，如果有任何疑虑或身体不适，建议及时就医并咨询专业医生的意见。
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