女人48岁月经来总不干净的原因可能有以下几种：
1. 绝经过渡期：这个阶段的患者由于稀发排卵或无排卵，导致月经周期不规律、月经时间长、经量异常等症状。
2. 无排卵性异常子宫出血：卵巢功能不断衰退，导致雌激素分泌量急速降低，不形成排卵期前黄体生成素高峰，无排卵，表现为月经紊乱，月经来了老不干净等症状。
3. 多囊卵巢综合症：可能由于某些遗传基因与环境因素相互作用所致，主要症状为月经失调，可表现为不规则子宫出血，出现月经来了老不干净的症状。
4. 生殖系统慢性炎症：如阴道炎、慢性子宫内膜炎、慢性盆腔炎等，炎症刺激容易导致月经持续不干净。
5. 内分泌失调：经常熬夜、生活不规律导致内分泌失调，也容易出现月经一直不干净。
6. 功能性子宫出血：没有器质性病变，月经持续不干净考虑是功能性子宫出血，多见于青春期。
7. 黄体功能不全：黄体功能不全、黄体萎缩，容易导致月经持续不干净。
8. 药物影响：如服用避孕药和精神类药物，只要把药物停了，过上1-2个月经就会恢复正常。
9. 上宫内节育环或药物流产术后刺激：容易出现月经延长、出血量增加的情况。
当出现这种情况时，建议尽早到医院就诊，完善相关检查，及时对症处理及治疗，切勿擅自治疗，以免造成不良后果。
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