月经干净后左侧输卵管部位疼痛可能有以下原因：
1. 左侧附件炎症：月经期间子宫附件充血，身体免疫力下降导致附件炎症加重，引起疼痛症状。需要做敏感菌群培养化验，使用敏感抗生素治疗，如甲硝唑、头孢类、左氧氟沙星类药物等。
2. 左侧卵巢囊肿：卵巢囊肿比较大，或者蒂扭转、破裂出血等，都可能会导致左侧小腹疼痛症状，需要及时去医院诊断确诊，必要的话及时开腹手术，或者腹腔镜手术治疗。
3. 左侧输卵管妊娠胎停或者部分流产以后，可能会引发陈旧性宫外孕，左侧小腹疼痛症状。需要医生明确诊断以后保守治疗，或者腹腔镜手术治疗等。
请注意，以上只是⼀些可能的原因。这种症状也可能与其他疾病有关，建议您去正规医院接受专业医生的指导和治疗。
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