怀孕42天B超看不到孕囊可能是以下几种原因：
1. 胚胎着床较晚：如果女性平时月经不规律，导致胚胎着床较晚，出现看不见孕囊、孕周偏小等症状，属于正常的情况，一般不需要特殊治疗。
2. 胎停育：如果胚胎存在基因异常的情况，就可能会导致胎停育，造成B超看不见孕囊，建议女性采用人工流产术的方式进行治疗。
3. 异位妊娠：该疾病是指胚胎着床在宫腔以外的位置，B超无法发现孕囊，女性需要及时采用腹腔镜手术、输卵管切开术等方式进行治疗。
4. 其他疾病：如滋养细胞疾病，妊娠试验也会显示阳性，但不是正常妊娠情况。需要进一步检查。
以上就是怀孕42天B超看不到孕囊的可能原因，建议咨询专业医生，根据检查结果选择合适的治疗方法。
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