小便尿道开始时痛可能有以下原因：
1. 尿路感染：泌尿系统包括肾脏、膀胱和输尿管以及连接它们的尿道。 当细菌进入泌尿系统时，会引起尿路感染，出现尿痛、小便灼热感、尿频、尿急、尿浊、下腹痛等症状。
2. 其他泌尿系统疾病：许多疾病会引起尿痛的症状。 常见疾病包括尿道炎、膀胱炎、急慢性前列腺炎、精囊炎、膀胱结石、尿道结石、膀胱结核等。
3. 化学因素刺激：例如，由于脱水时尿液的浓度，尿液中的化学成分刺激膀胱和尿道的粘膜，也会引起不同程度的尿痛症状。 有些药物，如膀胱肿瘤手术后输注的化疗药物，也会引起尿痛症状。
如果出现这种症状，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、泌尿超声等，并依据原因进行相应的处理。
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