同房后小肚子闷闷的不舒服可能是以下原因引起的：
1. 动作过于粗暴：同房时如果动作过于粗暴，可能会导致女性宫颈充血，男性阴茎充血，出现同房后小腹不舒服的情况。建议男性和女性半个月内禁止同房，同时通过毛巾热敷、按摩等方法来缓解症状。
2. 慢性前列腺炎：如果男性患有慢性前列腺炎，同房可能会导致前列腺充血、肿胀，从而出现同房后小腹不舒服的情况。男性患者可以在医生的指导下服用头孢拉定片、硫酸庆大霉素片、左氧氟沙星片等药物进行治疗；也可以通过温水坐浴、局部热敷等方法来缓解症状。
3. 卵巢囊肿：如果女性患有卵巢囊肿，同房会刺激病变的部位，从而导致卵巢囊肿扭转或者破裂，出现同房后小腹不舒服的情况。通常卵巢囊肿的治疗以手术为主，女性患者可以通过卵巢囊肿剔除术、输卵管卵巢切除术或者子宫切除术等方式进行治疗。
以上信息仅供参考，不舒服的症状持续的话，建议及时就医以获取专业的诊断和治疗。
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