眼睛充血的原因有很多，可能是由于细菌、病毒侵入眼睛引起的感染，高强度的工作使眼睛过度疲劳，或者是身体内存有炎症等。针对不同原因，需要使用不同的药物进行治疗。以下是一些可能的治疗药物：

1. 抗细菌药物：如果眼睛充血是由细菌感染引起的，可以使用抗生素药物进行治疗，如四环素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液、红霉素眼药膏等。
2. 抗病毒药物：如果眼睛充血是由病毒感染引起的，比如角膜炎或结膜炎，建议在医生的指导下使用阿昔洛韦滴眼液、更昔洛韦滴眼液等药物进行治疗。
3. 抗真菌药物：如果眼睛充血是由真菌感染导致的角膜炎，可以遵医嘱使用氟康唑滴眼液等进行治疗。
4. 抗炎药物：如果眼睛充血是由于炎症感染引起的，建议在医生的指导下使用双氯芬酸钠滴眼液等药物进行治疗。
5. 滋润眼睛的药物：如果眼睛充血是由于长时间使用电子设备、环境干燥等原因造成的眼部疲劳，可以使用人工泪液、润洁滴眼液等滋润眼睛的药物进行治疗。

需要注意的是，以上药物使用建议仅供参考，如果您的眼睛充血持续不减或者症状加重，强烈建议您及时就医。在医生的指导下进行诊断和治疗，以免造成不良后果。