肚脐上三指处隐隐作痛可能是以下原因导致：
1. 饮食不当：摄入过多辛辣刺激食物或是生冷油腻的食物，会导致胃肠道黏膜受到刺激，从而引起腹部疼痛。
2. 胃炎：胃部受到炎症反应的刺激，其功能运行会受到阻碍，此时胃酸异常分泌就会导致患者出现肚脐上方隐痛感。
3. 胃溃疡：该病情会导致胃黏膜出现溃疡，受损部位受到胃酸的刺激，就会出现腹部隐痛。
4. 其他可能性疾病：包括急性胃炎、消化性溃疡、胃癌、炎症性肠病、小肠梗阻、胰腺炎或胆囊结石、胆囊炎等。
当出现上述症状时，建议及时就医，通过相关检查明确病因，并积极进行治疗。
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