儿童发烧、头疼的常见原因包括以下几种：1、邻近器官感染：上呼吸道感染引发邻近器官感染，如上呼吸道离鼻腔较近，导致鼻窦炎、筛窦炎或上颌窦炎，由于鼻窦出现炎症、肿胀，就会出现发热、头疼。积极给予抗炎、抗病毒治疗，局部炎症消退后，发烧、头疼症状会随之减轻，恢复正常；2、中毒性脑病：由于上呼吸道感染时出现中毒性脑病，这时可能会出现无菌性颅内压增高，颅压增高时伴头疼症状，严重时可能还出现呕吐。一般局部炎症消退后，中枢神经系统内压力逐渐减轻，头疼症状也会随之改善；3、中枢神经系统感染：如出现细菌性、病毒性或结核性脑炎，可以出现发烧、头疼同时伴呕吐、嗜睡、昏睡、昏迷甚至抽搐等临床症状。