摘除胆囊后最主要的后遗症是可能出现消化功能不良的情况，这种情况只见于少部分患者，大部分患者并不会出现相关异常，主要是因为人体具有强大调节能力的器官组织。当胆囊切除后，可能是胆汁的储存库消失，从而胆汁的质量就有所下降。进食高脂肪、高胆固醇的食物时，因为胆汁的质量下降，而不能够达到很好的消化作用。这种情况下就会引起消化道异常，如腹胀、腹泻等不适症状，常见的是腹泻。由于过量的油脂无法分泌，会通过肠道，通过粪便排出，从而引起脂肪泻的表现。特别是胆囊手术前已经出现腹泻的患者，可能导致腹泻症状加重。大部分患者可以通过胆管的扩张，或其它肠道功能的调节进行调理，一般能够恢复正常。针对无法调理、有后遗症的患者，建议饮食上减少高脂肪、高胆固醇食物的摄入，经过积极饮食调整可以逐步地恢复正常，必要时可以使用药物进行辅助治疗。