胚胎停止发育多久会自然流产，需根据胚胎染色体异常、孕妇情况、停经时间多久决定，不是每个胚胎停止发育的孕妇都会自然流产，具体情况如下： 1、孕妇孕极早期如生化妊娠，可能孕30多天、孕40天时自然流产，自身染色体正常时，可能流产时间会较长； 2、部分胚胎，保胎药停止后，不会自然流产，一定要到专科医院妇产科，选择合适的终止妊娠方式。胚胎停止发育后不能长时间观察，因为诊断明确以后，在一定孕周内胚胎无生长，过度观察无任何意义。胚胎停止发育有部分患者反复生化妊娠，后期治疗中需要关注，尤其试孕后需开始积极治疗。