艾灸百会穴主要的好处如下：1、治疗头痛：百会穴为督脉上的穴位，督脉为阳脉之海，百会位于人体的最高点，所以为阳脉之巅，艾灸百会可治疗阳虚头痛、寒湿头痛等；2、补充阳气：艾灸百会可以补充督脉阳气，阳虚患者可通过艾灸百会补充阳气；3、提升阳气：对于胃下垂、子宫脱垂、阴道脱垂以及脱肛等中气下陷的患者，艾灸百会为较常用且有效的治疗方法；4、治疗失眠：失眠有多种类型，如阴虚火旺、心肾不交等引起的失眠不适合进行艾灸，而由于阳虚和气虚引起的失眠可艾灸百会进行治疗。艾灸百会可调节人体的植物神经系统，使功能紊乱得到有效改善，从而治疗失眠。