肛瘘手术后是否要特别补充营养，需要具体情况具体分析，具体如下：1、一般不需要：对于目前的中国现状，绝大多数患者的营养并不缺乏。因此，肛瘘术后的恢复并不建议进行特殊的营养补充，即不需要吃特殊的营养食品，若非要吃营养食品，则选用高蛋白的食物，比如蛋白粉；2、需要补充：但有些特殊情况下需要进行特殊补充，比如克罗恩病引起的肛瘘。因为此时肛瘘是特殊原因，所以术后创面的处理非常复杂。此外，也需要患者进行配合，但患者的配合是不能吃导致疾病加重、可能致病的食物。此外，若是结核病导致肛瘘需要补充蛋白质，因为结核导致肛瘘时可能伴有营养不良，所以患者可能需要补充蛋白质。但若不是以上两种特殊原因引起的肛瘘，患者在手术治疗的围手术期不需要进行特殊的营养补充。