甲肝的检查指标主要是血清抗体的检测，在血清中发现甲肝IgM抗体时可以确诊。患者出现症状时，血清中可以检测到IgM抗体，在急性感染期和早期恢复期，IgM抗体可以达到很高的水平，并且在随后的3-6个月仍能够检测到。无临床症状的患者体检时，如果测到血清IgM抗体，可能说明既往感染甲肝后，血清中长期存在IgM的抗体，是假阳性或无症状感染者，小于6岁的儿童比年龄更大的儿童或者成年人更常见无症状感染的情况。血清IgG抗体在疾病恢复早期出现，并且能够持续存在数10年，与终身保护性免疫相关。发现甲肝IgG抗体，但没有测出甲肝IgM抗体时，通常反应既往感染或者注射过甲肝疫苗，而不是急性感染。