下面起小疙瘩还疼的常见原因包括以下几种：1、阴道炎：如阴道炎症，清洁度不好以及霉菌性阴道炎、细菌性阴道病、滴虫性阴道炎，阴道中的炎症分泌物流出刺激外阴黏膜，形成假性的软疣湿疣；2、毛囊炎：由外部刺激引起，一部分女性常年使用护垫、化纤衣物，不透气，导致外阴不干爽，引起毛囊局部金黄色葡萄球菌的感染，出现疼、痒等症状，类似于痘痘，色红且有白色脓头；3、低危型HPV感染：会导致外阴尖锐湿疣的发生，疼痛不明显，但很硬，呈簇状。