偏头疼患者脑梗死或者脑血栓形成概率远高于普通人。在发作或发作过程中避免脑血栓形成，及时终止发作，可以使用钙离子拮抗剂药物防止血管过度痉挛以及兴奋，造成血管内皮细胞损伤。亦可以调节饮食，避免兴奋性的含有酒类、赖氨酸类或腌制食品，另外尽量避免饮用兴奋性较强的浓茶、咖啡，减少偏头痛发作。适当运用预防性药物，例如钙离子拮抗剂、抗癫痫药物，如果偏头痛患者经常发作时，可以服用上述药物预防，减少偏头痛发作，均可以有效减少或者避免脑血栓形成。