两侧太阳穴胀痛的原因较多，具体如下：1、感冒、发烧：可以出现两侧太阳穴发胀、疼痛，还会出现颈部酸痛、四肢乏力等综合症状；2、扩张血管药物副作用：可以使脑部血管扩张，出现两侧太阳穴胀痛；3、其它：失眠、压力大、用脑过度、高血压等疾病也可以造成两侧太阳穴发胀、疼痛等情况。两侧太阳穴的胀痛只是临床症状，可能是很多疾病的表现，应该参考患者其他症状、体征，参考影像学检查以及其他检查线索，从而进行综合分析。出现此类情况的患者应该及时就诊，找到病因进行对因治疗加上对症治疗的综合治疗，包括药物治疗、理疗、心理疏导、环境改变等，从而可以争取较好的预后。