肾小管间质损伤通常不严重，但如果小管损伤是慢性进行性损伤，发展到最后可造成病人出现肾功能不全，甚至尿毒症，从这个角度看算严重。肾小管间质损伤的原因可与药物有关，中药和保健品中药里常见含有马兜铃酸的中药。这类的中药虽然临床上已经禁用几个，但也有相当多药物因为马兜铃酸含量不算太高，所以并没有在临床上得到禁用。导致用药时造成病人肾小管损伤，长时间可导致病人肾小管进展性损伤，或者间接性损伤，从而导致病人出现肾功能不全，甚至尿毒症。其它过敏性因素，也可导致肾小管间质损伤。给病人抗感染治疗后，肾小管间质损伤通常可得到较好的恢复。