治疗内分泌功能紊乱的方法如下：一、器质性疾病引起的内分泌紊乱：1、治疗原发病：如甲亢、甲减等，必须针对性地治疗原发病。对于肝脏、肾脏、心脏等器质性疾病或自身免疫性疾病引起的内分泌紊乱，必须治疗原发病，否则很难纠正内分泌紊乱；2、激素替代治疗：对于卵巢早衰等情况，可以考虑进行激素替代治疗。二、功能性内分泌紊乱：1、自我心理调整：对于由精神、心理或情绪、生活和工作变故的刺激等因素引起的内分泌紊乱，建议首先进行自我心理调整；2、寻求专业帮助：如果确实有情绪问题，或者焦虑、抑郁、严重失眠，自我调整无效，可咨询心理医生或中医师等专业人士，寻求帮助进行调理。在纠正或治疗内分泌功能紊乱时，必须分析病因，因为不同的病因需要采取不同的治疗方法。