晚上睡觉全身骨头疼的原因如下：1、骨质疏松脱钙加快：随着年龄增长，特别是女性在绝经后雌激素水平下降非常快，导致骨头脱钙加快、钙沉积减慢，特别是夜间，因为没有食物的摄入、钙的补充、阳光照射、维生素D的生成，导致骨头脱钙进一步加快，部分患者会出现全身骨头的疼痛、酸疼，最后提示可能存在缺钙而骨质疏松，这时需要做检查，通过口服钙片、活化的维生素D缓解症状，严重患者可以加用二膦酸盐，抑制破骨细胞活性的药物，缓解疼痛；2、其他：比如有些肿瘤患者的骨转移，也会引起全身骨头酸痛。甲状旁腺功能亢进等内分泌疾病，也会导致脱钙的加快，需要到相应科室做检查明确诊断，根据病因进一步治疗。