右肾区疼痛的原因有很多，要根据病人的症状、体征和检查找到疼痛的原因并且给予对因治疗，具体如下：一、肾外性原因：一般是运动性损伤，主要常见的是腰扭伤，如果有运动损伤的病史，通常可以用膏药或者用止疼药看效果如何，如果效果不好有时就要想到肾性原因。二、肾性原因：1、肾囊肿：肾囊肿压迫到肾脏包膜或者压迫到肾盂时就会出现疼痛，这时做超声看肾囊肿的大小，如果囊肿足够大要考虑抽囊液、打固化剂或去顶减压术。另外肾囊肿囊内有出血和感染的时候，也会有局部的疼痛，这时也是要找到原因再给予对因治疗，看是否要用止血药物、抗菌素等；2、肾结石：肾结石发作的时候可以引起剧烈的疼痛，肾结石不发作的时候也可以引起钝痛，主要是通过超声进行判断；3、炎症：肾盂肾炎时也会出现疼痛，但是肾盂肾炎通常是双侧疼痛；4、肾脏结核：肾脏结核也会引起疼痛，这时需要看结核抗体高不高、尿中能不能查到结核菌来进行判断。