肾区疼痛的原因有两个方面，一方面是肾脏原因引起的疼痛，另一个方面就是肾外原因引起的疼痛，肾外原因大多数是局部的肌肉、关节、筋膜等导致，肾性疼痛的原因也有很多，比较常见的原因如下：1、肾囊肿：肾囊肿足够大时，会刺激到肾脏包膜，或者刺激肾盂，出现肾区疼痛。另外，如果是囊肿内有出血，或者有感染时，病人也会感觉到肾区疼痛；2、肾脏结石：如果是比较大的结石，可以引起肾区锐痛或者绞痛。如果比较小的结石，可能引起肾区的钝痛或者隐隐作痛；3、感染：常见的感染就是肾盂肾炎，急性肾盂肾炎可能引起局部的腰痛、发热等症状。慢性肾盂肾炎的病人可能仅会出现局部腰痛或者腰部的隐隐作痛等症状；4、肾积水：如果积水量比较多，也会牵拉到肾盂，然后导致病人出现肾区隐痛。所以如果发现病人的肾区疼痛，还是要根据以上的一些原因来进行排查。