如果发现了卵巢囊肿，在除外生理性囊肿的情况下，确认是病理性囊肿，建议手术切除，因为其危害比较大。相当一部分人的卵巢囊肿有恶变几率，有人统计过，如巧克力囊肿，得卵巢癌的几率是正常人的9倍，而且其恶变是变成一个特别恶性的透明细胞癌。卵巢囊肿包括上皮性，其中浆液性、黏液性，都有可能变成交界或者是恶性，危害比较大。此外，还有生殖细胞来源的，如畸胎瘤，这些囊肿可能其危害相对小，恶变的几率较小。但是畸胎瘤长到中等大小，一般是一侧沉一侧轻，还有可能会导致扭转。如果扭转，会带着这侧卵巢，形成剧烈腹痛，如果处理不及时，还有可能坏死在肚子里，此时危害就更大。有可能会丧失一个卵巢，如果双侧都有囊肿，还会丧失卵巢的生育功能、内分泌功能。因此，卵巢囊肿的危害比较大，临床一般建议积极处理。