耳后根阵痛的常见原因如下：1、枕大神经痛：表现为针刺样、电击样，从耳后向上出现短暂、剧烈疼痛；2、早期面神经炎：由于面神经主要走行于面神经管，即耳后颞骨位置，面神经炎发生之前，可以伴耳后疼痛。如果有受凉病史，一定要警惕有无后续面神经炎；3、病毒感染：如带状疱疹病毒，会有此类疼痛，同时可能在疼痛中期出现皮肤局部水疱，如果出现一定要及时到皮肤科就诊；4、其他原因：由于耳后位置属于脑部的一部分，所以出现不典型血压增高、小量脑出血时可能伴疼痛。所以，突然出现耳后疼痛，建议进行血压监测以及脑部CT检查。