两个耳朵后根疼有几种情况，包括上呼吸道感染、外耳道或鼓膜出现急性炎症、中耳炎、中耳腔里面有积液或者有肿物、耳部周围神经病变等，具体如下：1、上呼吸道感染：当身体抵抗力下降，细菌、病毒侵犯到上呼吸道出现上呼吸道感染的时候，有可能出现颌下淋巴结以及耳后淋巴结炎症，会表现到两个耳朵，感觉两个耳朵后根疼痛；2、外耳道或鼓膜出现急性炎症：炎症刺激到耳部周围的神经，也会出现两个耳朵感到耳朵后面疼痛；3、中耳炎、中耳腔里面有积液或者有肿物：当中耳腔内有病变的时候可以放射引起耳部周围，甚至两个耳后根出现疼痛；4、耳部周围神经病变：本身耳朵没有疾病，但是由于耳部周围的神经出现病变，也可以出现两个耳朵后感到疼痛。