艾灸在临床上应用较为广泛，但如果使用错误，或者在不适合艾灸时进行艾灸的治疗，会导致许多不良反应，即不适合艾灸，出现的副作用。 发热时进行艾灸治疗，或在高血压出现头晕、头痛等症状时进行艾灸治疗，会导致血压升高，甚至体温再次升高。 如果患者存在上火的症状，如口干、口渴、眼睛干，鼻子干，甚至口腔溃疡，即所谓的热证、上火、阴虚阳亢时，也不宜进行艾灸，否则会加重上火症状。 此外，孕妇腹部、腰骶部不宜进行艾灸，但四肢等躯干部位可适当进行艾灸治疗，若对腰骶部、腹部进行艾灸，会对胎儿造成严重不良反应。