结肠水疗也称结肠SPA，方法较为古老，也较为安全，在医院、保健会所，甚至在家庭都可以进行。一般有一个水疗仪器，将水加热至37℃左右，在肛门插入软管，大概插入肛门10cm，将温水注入肠道内，温水可以稀释、软化大便，刺激肛门附近的括约肌松弛，刺激肠道蠕动，将稀释的大便排出肠道。反复进行上述操作，直到将结肠内大便以及代谢的废物、有毒物质全部冲洗干净。结肠水疗的过程大概为45分钟，通常要休息5分钟左右才能起身，完成水疗。