如果阴道最深处疼痛，有可能是下列疾病导致：1、盆腔炎症：当盆腔有炎症的时候，通常会导致结缔组织出现炎症性反应，充血、水肿，并且还可能会出现大量的渗出，导致盆腔积液。而这些积液往往会波及穹窿部位，所以会引起阴道最深处出现疼痛。通过妇科检查明确诊断之后，建议尽快给予抗炎治疗，并且也要注意休息、加强营养，提高机体的抵抗力；2、子宫内膜异位症：有可能是在穹窿处有子宫内膜异位症的病灶，所以会出现疼痛，尤其是在来月经的时候，疼痛通常会出现加重的现象。建议一旦明确诊断，可以考虑手术治疗，在手术之后有可能还会出现复发，因此需要做后续的治疗；3、宫颈癌：如果阴道最深处出现疼痛，也有可能是宫颈癌波及阴道穹窿部，所以会引起疼痛，还会出现不规则流血、同房出血等。一旦经过病理检查，明确诊断之后，如果还有手术的可能，尽快做手术治疗。