导致尿结石的因素很多，通常包括全身性因素和局部性因素。全身性因素主要包括自身的新陈代谢紊乱，例如甲状腺功能亢进的病人，或甲状旁腺功能亢进的病人，存在自身代谢紊乱，容易形成尿路结石。另外与生活环境有关，例如南方天气热、出汗多，也可能会出现泌尿系结石。还与饮水有关，住在山区的居民因为水质含钙比较丰富，也很容易出现肾结石。肾结石还与种族、遗传等一系列因素有关。引起肾结石的局部因素主要包括病人自身的解剖结构出现问题，例如肾盂输尿管连接处出现狭窄，这种情况可导致尿流不畅，容易长成结石。还包括解剖畸形，部分病人是因为双侧肾盂双肾输尿管畸形，导致尿液在下降的过程中不顺畅，也容易形成结石。此外，病人自身存在异物，也可能会长结石，例如膀胱内有异物，或者以前手术在膀胱内遗留有线头，在异物的附着下也容易形成结石。还有尿路感染、膀胱出口梗阻这些疾病也容易形成结石，例如老人前列腺增生，因为膀胱出口梗阻，每次排尿不尽，尿液长期在膀胱内停留，也容易形成泌尿系结石，主要是指膀胱结石。