颈动脉内膜剥脱手术是比较成熟、比较安全的手术方式，对于绝大部分患者是安全、可靠、风险较小的。在美国有经验的医生可将颈动脉内膜剥脱手术并发症控制在3%之内，包括颅神经损伤、局部出血、血肿、气管移位、窒息等；还有由于内膜剥离引起的远端脑栓塞或者由于阻断引起的远端脑出血；还包括手术引发的脑再灌注损伤。颈动脉狭窄合并其他心血管疾病、脑血管疾病或者代谢性疾病，围手术期可产生一系列并发症，比如心肌梗死、脑梗塞、糖尿病等；还有围手术期麻醉风险，比如气管插管、麻醉药物而产生的麻醉意外；围手术期颈动脉内膜剥脱手术而引起的全身问题，包括对病人精神、情绪的影响，有些病人手术后过度兴奋或者抑郁。总而言之，术后并发症虽比较繁琐、比较复杂，但发生率并不高。